第39卷第1期
2012年1月
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浙江大学学报(理学版) of Zhej i ang U ni ver si t y(S ci ence Edi t i on) ht t p ://ww w .j our nal s .zj u .edu .c n /s ci
V o I .39N o .1
Jan .2012
130I :10.378s /j .i ss n .1008—9497.2012.01.013
G SK 一3抑
吕
制剂药效团模型的构建
娜h2,罗海彬3
杨1”,蒋勇军¨,潘善飞1’2,代
(1.浙江大学化学系,浙江杭州310027;2.浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程
市重点实验室,浙江宁波315104;3.中山大学药学院,广东广州510006)
摘
要:选择活性跨越0.08~100
000
nm ol L “的8类共30个G SK 一3竞争性抑制荆小分子作为训练集,其余490
2.5软件,筛选得到由1个氢键受
l i ent 个不同结构和活性的小分子作为测试集.采用A cce l r ys D i s co ver y St ut i o C
体,1个氢键供体、1个疏水中心、1个环芳香性和1个排除体积组成的最佳模型(Cor r el =0.900,C onf i g=13.962,
A c ost =90.725) ,采用测试集与分子对接方法对模型进行评价,表明该模型具有较强的预测能力,为进一步的数据库搜索及寻找新型G SK 一3抑制荆先导物提供了依据.
关
键
词:G SK 一3抑制荆;药效团;分子对接;抑制剂设计
641
中图分类号:0文献标志码:A 文章编号:1008—9497(2012) 01一060—07
L 0Y a i —bi n 3(1.D N G Y A I N ah2,L U O H an91矗l JI A ong —j un2,PA N S han —f ei l ’2。D epa r t m ent of C hem i s t r y ,Z he —j i ang U ni ve r si t y ,H angzhou
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odel c o ns t r uct i o n of gl yc o gen s y nt ha se ki na se -3i nhi bi t or s .J ournal P har m acophor e m di t i on) ,2012。39(1) :060—066
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糖原合成酶激酶一3(G SK 一3) 是一类多功能的丝氨酸/苏氨酸类蛋白激酶,其普遍存在于所有的真核细胞中,在哺乳动物中有G SK -3a 和G SK 一362种类型,催化区域的氨基酸序列同源性高达98%[1].G SK 一3通过对底物蛋白的磷酸化参与糖原的合成、多种蛋白的转录激活、细胞增殖、细胞分化和细胞运动等生理过程,同时在W nt /w i ngl es s ,P13一ki nas e
收稿日期:2010-09—21.
及H edgehog 信号转导通路中扮演重要的角色[2-4].G SK 一3磷酸化底物的作用方式比较特殊,大多数的底物需要先被另外一种激酶预磷酸化,才可与G SK 一3作用.但当其过度磷酸化底物或在体内表达不当时,将导致异常的生理功能,引起一系列如阿尔茨海默病L5|,癌症£6],I l 型糖尿病[73等人类难以克服的疾病.因此,G SK 一3小分子抑制剂有望成为治愈
基金项目:国家自然科学基金资助项目(20803063) ;宁波市自然科学基金资助项目(20l O A 610024) ;科技重大专项“临床前药物代谢动力
学技术平台”(2009ZX09304—003) 资助.
作者简介:吕
杨(1986一) 。男。硕士。主要从事药物分子合成与设计研究.
*通信作者。E —m ai l :yj j i an g@ni t .zj u .edu .ca .
第39卷第1期
2012年1月
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(1.浙江大学化学系,浙江杭州310027;2.浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程
市重点实验室,浙江宁波315104;3.中山大学药学院,广东广州510006)
摘
要:选择活性跨越0.08~100
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关
键
词:G SK 一3抑制荆;药效团;分子对接;抑制剂设计
641
中图分类号:0文献标志码:A 文章编号:1008—9497(2012) 01一060—07
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基金项目:国家自然科学基金资助项目(20803063) ;宁波市自然科学基金资助项目(20l O A 610024) ;科技重大专项“临床前药物代谢动力
学技术平台”(2009ZX09304—003) 资助.
作者简介:吕
杨(1986一) 。男。硕士。主要从事药物分子合成与设计研究.
*通信作者。E —m ai l :yj j i an g@ni t .zj u .edu .ca .