质粒大量提取试剂盒(离心柱型)
一、试剂盒组成、储存、稳定性
试剂盒组成RNase A(10mg/ml)
溶液Ⅰ溶液Ⅱ溶液Ⅲ漂洗液W1漂洗液W2洗脱缓冲液EB 吸附柱AC 收集管(50ml)
保存-20℃4℃室温室温室温室温室温室温室温
5次(SP021)
300µl30ml 30ml 40ml 55ml 65ml
10次(SP022)
600µl60ml 60ml 80ml 110ml 130ml
第一次使用前按说明加指定量乙醇
10ml 5个5个
20ml 10个10个
本试剂盒在室温储存18个月不影响使用效果。
注意事项
1.第一次使用时,将试剂盒所带全部的RNase A 加入溶液Ⅰ后(终浓度100μg/ml)置于4℃保存。如
果溶液Ⅰ中RNase A 失活,提取的质粒可能会有混杂有微量RNA 残留,这时可在溶液Ⅰ中补加RNase A 即可。
2.第一次使用前请先在漂洗液W2瓶中加入与W2相同体积无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打
钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
3.环境温度低时溶液Ⅱ中SDS 可能会析出出现浑浊或者沉淀,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清,
不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。
4.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
二、原理简介
本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞,然后离心吸附柱内的硅基质膜在高盐,低PH 值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,最后低盐,高PH 值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA 从硅基质膜上洗脱。
三、试剂盒特点
1.离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了
国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。
2.不需要使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀。快速,方便,从100-200ml 大肠杆
菌LB((Luria-Bertani)培养液中,可快速提取0.5-1.5mg 纯净的高拷贝质粒DNA,提取率达85%左右。
3.获得的质粒产量高,超螺旋比例高,纯度好,直接可以用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序
等各种分子生物学实验。
四、注意事项(实验前必须首先阅读这部分!)
1.所有的离心步骤如未加另外说明均在室温完成,使用转速可以达到至少5,000g,带50ml转头的
台式离心机。
2.溶液Ⅱ、溶液Ⅲ、W1含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。
若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
提取的质粒量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb 的大质粒,应加大菌体使用量,同时按比例增加Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ的用量,洗脱缓冲液应在70℃预热。可以适当的延长吸附和洗脱的时间,以增加提取效率。
3.得到的质粒DNA 可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260值为1相当于大
约50μg/mlDNA。电泳可能为单一条带,也可能为2条或者多条DNA 条带,这主要是不同程度的超螺旋构象质粒泳动位置不一造成,与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过90%。
4.要知道质粒DNA 确切分子大小,必须酶切线性化后,对比DNA 分子
量Marker 才可以知道,处
于环状或者超螺旋状态的的质粒泳动位置不确定,是无法通过电泳知道确切大小的。5.洗脱液EB 不含有螯合剂EDTA, 不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确
保PH 大于7.5, PH 过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-20℃。质粒DNA 如果需要长期保存,可以用TE 缓冲液洗脱(10mMTris-HCl,1mM EDTA,PH8.0),但是EDTA 可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
6.洗脱液EB 不含有螯合剂EDTA, 不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确
保PH 大于7.5, PH 过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-20℃。质粒DNA 如果需要长期保存,可以用TE 缓冲液洗脱(10mMTris-HCl,1mM EDTA,PH8.0),但是EDTA 可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
五、操作步骤
*第一次使用前请先在漂洗液W2瓶中加入与W2相同体积的无水乙醇!*将RNase A 全部加入溶液Ⅰ中,混匀,每次使用后置于2-8℃保存。*将溶液Ⅲ放在冰上预冷。
1.取100-200毫升过夜培养的菌液,6000g,离心5-10分钟,弃上清,收集菌体,尽可能的倒干上清。
处理超过50毫升菌液可以离心弃上清后,在同一个50ml 管内加入更多的菌液,重复步骤1,直到收集到足够的菌体。
2.用5ml 溶液Ⅰ重悬菌体沉淀,移液器吹打或者涡旋振荡至彻底悬浮。
如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。
3.加5ml 的溶液Ⅱ,温和地上下翻转4-7次使菌体充分裂解,室温放置4分钟。
温和地混合,不要剧烈震荡,以免基因组DNA 剪切断裂!所用时不应超过5分钟!以免质粒受到破坏。此时菌液应变得清亮粘稠,如果菌体少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要准确的5分钟。如果未变得清亮,可能由于菌体过多,裂解不彻底,应减少菌体量。
4. 加7ml 溶液Ⅲ,立即温和地上下翻转4-7次,充分混匀此时会出现白色絮状沉淀。冰上静置10分钟,4℃,至少5000g 离心10分钟(加大离心力可相应缩短离心时间),小心取上清,避免吸取到
漂浮白色沉淀。加入溶液Ⅲ后应该立即混匀,以免产生SDS 的局部沉淀,如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。
5. 可选步骤:4℃,5000g再次离心10分钟,小心取上清。
6. 将上一步所得上清液加入吸附柱AC 中(吸附柱放入收集管中),静置2分钟,5000g 离心3分钟(为了保护膜最好慢启动),倒掉收集管中的废液。如果上清体积超过20ml,可以分多次过柱。7.加入10ml 漂洗液W1,5000g离心3分钟,弃掉废液。
8.加入12ml 漂洗液W2(请先检查是否已加入无水乙醇!),5000g离心3分钟(为了保护膜最好慢启动),弃掉废液。9.重复操作步骤8一次。
10.将吸附柱AC 放回空收集管中,最高速(最好大于8,000g)离心5-10分钟以干燥膜基质残留乙
醇,用枪头吸除内圈压环和柱壁之间可能残留的乙醇,室温或者烘箱晾干几分钟。
该步骤为彻底去除吸附柱中残留乙醇,残留乙醇抑制下游反应并且严重降低洗脱效率,降低质粒产量。如果洗脱产量低,则必须加做步骤11。11.可选步骤:选择以下两种方法干燥柱子:
a.取下柱子放置于真空容器中,密封真空容器,提供真空15分钟;b.将柱子放置于65℃真空干燥箱或烘箱中,放置10-15分钟。
12. 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加1.5ml 洗脱缓冲液EB(洗脱
缓冲液事先在65-70℃水浴中预热),室温放置2分钟,5000g离心3分钟。如果需要较多量质粒,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,离心2分钟。
洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要质粒浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于1ml,体积过小降低质粒洗脱效率,减少质粒产量。
六、疑难解答(Trouble shooting )
出现的问题
可能的原因
培养基中忘加抗生素,非质粒转化细胞过度生长
细菌培养时间太长,老化细菌开始裂解
建议解决方法
确保固体,液体培养基中都加入了适当的抗生素。
接种适量的起始菌液于加了合适抗生素的培养基中培养12-16个小时
质粒DNA 产量低
使用了低拷贝数质粒
建议使用高拷贝数质粒,低拷贝数质粒应该适当加大处理体积。
细菌培养时间过短,菌液内细菌浓度过低
细菌细胞裂解不完全
细菌培养到[A600]吸光值为2 -4的时候收集菌体。
使用建议的菌体处理量处理菌体,不要过量;涡旋或者吹打,确保菌
体充分重悬于溶液Ⅰ中,不应该见到未散开的细菌团块;加入裂解液P2裂解后,应该是粘稠和透明的。
质粒DNA 产量使用分光光度计定量不准确洗脱效率不高
分光光度计定量常常偏高,使用琼脂糖电泳/EB染色定量
请阅读实验步骤10-12和注意事项6
漂洗液W2中忘记加无水乙醇
第一次实验时,在漂洗液W2中加入与W2相同体积无水乙醇
未提取到质粒DNA
质粒洗脱液含有较多乙醇,琼脂糖电泳/EB染色定量时质粒DNA 漂出上样孔
忘记做步骤10,乙醇抑制了酶切反应
质粒DNA 下游酶切不
让残留乙醇挥发。
能切开或者酶切不
一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑
完全
制了酶切反应
混杂有基因组DNA 污染
质粒DNA 上缺口或者电泳上超螺旋带前出现变性质粒带产物中含有RNA 污染
第一次做实验时候,忘记将RNase A 加入溶液Ⅰ,RNaseA 失活或者起始处理量过量
第一次实验前确保将RNase
A 加
裂解步骤3时间过长在裂解时基因组被剪切打断了
再离心一分钟,小心取上清使用,做步骤3时轻柔的通过颠倒混匀,不要涡旋或者剧烈震荡。裂解时间不要超过5分钟。将洗脱的质粒DNA 溶液13,000rpm 确保已经做了步骤10,将离心吸附柱的乙醇残留去除;或者适当提高上样缓冲液浓度。
做步骤10,然后空气中晾几分钟,
入了溶液Ⅰ;溶液Ⅰ超过3个月的,可加入一些新RNase A 在溶液P1;处理量不要过量;菌体重悬于溶液Ⅰ后可放置几分钟让RNase A 充分起作用后再进行下一步。
质粒大量提取试剂盒(离心柱型)
一、试剂盒组成、储存、稳定性
试剂盒组成RNase A(10mg/ml)
溶液Ⅰ溶液Ⅱ溶液Ⅲ漂洗液W1漂洗液W2洗脱缓冲液EB 吸附柱AC 收集管(50ml)
保存-20℃4℃室温室温室温室温室温室温室温
5次(SP021)
300µl30ml 30ml 40ml 55ml 65ml
10次(SP022)
600µl60ml 60ml 80ml 110ml 130ml
第一次使用前按说明加指定量乙醇
10ml 5个5个
20ml 10个10个
本试剂盒在室温储存18个月不影响使用效果。
注意事项
1.第一次使用时,将试剂盒所带全部的RNase A 加入溶液Ⅰ后(终浓度100μg/ml)置于4℃保存。如
果溶液Ⅰ中RNase A 失活,提取的质粒可能会有混杂有微量RNA 残留,这时可在溶液Ⅰ中补加RNase A 即可。
2.第一次使用前请先在漂洗液W2瓶中加入与W2相同体积无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打
钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
3.环境温度低时溶液Ⅱ中SDS 可能会析出出现浑浊或者沉淀,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清,
不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。
4.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
二、原理简介
本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞,然后离心吸附柱内的硅基质膜在高盐,低PH 值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,最后低盐,高PH 值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA 从硅基质膜上洗脱。
三、试剂盒特点
1.离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了
国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。
2.不需要使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀。快速,方便,从100-200ml 大肠杆
菌LB((Luria-Bertani)培养液中,可快速提取0.5-1.5mg 纯净的高拷贝质粒DNA,提取率达85%左右。
3.获得的质粒产量高,超螺旋比例高,纯度好,直接可以用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序
等各种分子生物学实验。
四、注意事项(实验前必须首先阅读这部分!)
1.所有的离心步骤如未加另外说明均在室温完成,使用转速可以达到至少5,000g,带50ml转头的
台式离心机。
2.溶液Ⅱ、溶液Ⅲ、W1含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。
若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
提取的质粒量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb 的大质粒,应加大菌体使用量,同时按比例增加Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ的用量,洗脱缓冲液应在70℃预热。可以适当的延长吸附和洗脱的时间,以增加提取效率。
3.得到的质粒DNA 可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260值为1相当于大
约50μg/mlDNA。电泳可能为单一条带,也可能为2条或者多条DNA 条带,这主要是不同程度的超螺旋构象质粒泳动位置不一造成,与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过90%。
4.要知道质粒DNA 确切分子大小,必须酶切线性化后,对比DNA 分子
量Marker 才可以知道,处
于环状或者超螺旋状态的的质粒泳动位置不确定,是无法通过电泳知道确切大小的。5.洗脱液EB 不含有螯合剂EDTA, 不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确
保PH 大于7.5, PH 过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-20℃。质粒DNA 如果需要长期保存,可以用TE 缓冲液洗脱(10mMTris-HCl,1mM EDTA,PH8.0),但是EDTA 可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
6.洗脱液EB 不含有螯合剂EDTA, 不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确
保PH 大于7.5, PH 过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-20℃。质粒DNA 如果需要长期保存,可以用TE 缓冲液洗脱(10mMTris-HCl,1mM EDTA,PH8.0),但是EDTA 可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
五、操作步骤
*第一次使用前请先在漂洗液W2瓶中加入与W2相同体积的无水乙醇!*将RNase A 全部加入溶液Ⅰ中,混匀,每次使用后置于2-8℃保存。*将溶液Ⅲ放在冰上预冷。
1.取100-200毫升过夜培养的菌液,6000g,离心5-10分钟,弃上清,收集菌体,尽可能的倒干上清。
处理超过50毫升菌液可以离心弃上清后,在同一个50ml 管内加入更多的菌液,重复步骤1,直到收集到足够的菌体。
2.用5ml 溶液Ⅰ重悬菌体沉淀,移液器吹打或者涡旋振荡至彻底悬浮。
如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。
3.加5ml 的溶液Ⅱ,温和地上下翻转4-7次使菌体充分裂解,室温放置4分钟。
温和地混合,不要剧烈震荡,以免基因组DNA 剪切断裂!所用时不应超过5分钟!以免质粒受到破坏。此时菌液应变得清亮粘稠,如果菌体少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要准确的5分钟。如果未变得清亮,可能由于菌体过多,裂解不彻底,应减少菌体量。
4. 加7ml 溶液Ⅲ,立即温和地上下翻转4-7次,充分混匀此时会出现白色絮状沉淀。冰上静置10分钟,4℃,至少5000g 离心10分钟(加大离心力可相应缩短离心时间),小心取上清,避免吸取到
漂浮白色沉淀。加入溶液Ⅲ后应该立即混匀,以免产生SDS 的局部沉淀,如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。
5. 可选步骤:4℃,5000g再次离心10分钟,小心取上清。
6. 将上一步所得上清液加入吸附柱AC 中(吸附柱放入收集管中),静置2分钟,5000g 离心3分钟(为了保护膜最好慢启动),倒掉收集管中的废液。如果上清体积超过20ml,可以分多次过柱。7.加入10ml 漂洗液W1,5000g离心3分钟,弃掉废液。
8.加入12ml 漂洗液W2(请先检查是否已加入无水乙醇!),5000g离心3分钟(为了保护膜最好慢启动),弃掉废液。9.重复操作步骤8一次。
10.将吸附柱AC 放回空收集管中,最高速(最好大于8,000g)离心5-10分钟以干燥膜基质残留乙
醇,用枪头吸除内圈压环和柱壁之间可能残留的乙醇,室温或者烘箱晾干几分钟。
该步骤为彻底去除吸附柱中残留乙醇,残留乙醇抑制下游反应并且严重降低洗脱效率,降低质粒产量。如果洗脱产量低,则必须加做步骤11。11.可选步骤:选择以下两种方法干燥柱子:
a.取下柱子放置于真空容器中,密封真空容器,提供真空15分钟;b.将柱子放置于65℃真空干燥箱或烘箱中,放置10-15分钟。
12. 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加1.5ml 洗脱缓冲液EB(洗脱
缓冲液事先在65-70℃水浴中预热),室温放置2分钟,5000g离心3分钟。如果需要较多量质粒,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,离心2分钟。
洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要质粒浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于1ml,体积过小降低质粒洗脱效率,减少质粒产量。
六、疑难解答(Trouble shooting )
出现的问题
可能的原因
培养基中忘加抗生素,非质粒转化细胞过度生长
细菌培养时间太长,老化细菌开始裂解
建议解决方法
确保固体,液体培养基中都加入了适当的抗生素。
接种适量的起始菌液于加了合适抗生素的培养基中培养12-16个小时
质粒DNA 产量低
使用了低拷贝数质粒
建议使用高拷贝数质粒,低拷贝数质粒应该适当加大处理体积。
细菌培养时间过短,菌液内细菌浓度过低
细菌细胞裂解不完全
细菌培养到[A600]吸光值为2 -4的时候收集菌体。
使用建议的菌体处理量处理菌体,不要过量;涡旋或者吹打,确保菌
体充分重悬于溶液Ⅰ中,不应该见到未散开的细菌团块;加入裂解液P2裂解后,应该是粘稠和透明的。
质粒DNA 产量使用分光光度计定量不准确洗脱效率不高
分光光度计定量常常偏高,使用琼脂糖电泳/EB染色定量
请阅读实验步骤10-12和注意事项6
漂洗液W2中忘记加无水乙醇
第一次实验时,在漂洗液W2中加入与W2相同体积无水乙醇
未提取到质粒DNA
质粒洗脱液含有较多乙醇,琼脂糖电泳/EB染色定量时质粒DNA 漂出上样孔
忘记做步骤10,乙醇抑制了酶切反应
质粒DNA 下游酶切不
让残留乙醇挥发。
能切开或者酶切不
一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑
完全
制了酶切反应
混杂有基因组DNA 污染
质粒DNA 上缺口或者电泳上超螺旋带前出现变性质粒带产物中含有RNA 污染
第一次做实验时候,忘记将RNase A 加入溶液Ⅰ,RNaseA 失活或者起始处理量过量
第一次实验前确保将RNase
A 加
裂解步骤3时间过长在裂解时基因组被剪切打断了
再离心一分钟,小心取上清使用,做步骤3时轻柔的通过颠倒混匀,不要涡旋或者剧烈震荡。裂解时间不要超过5分钟。将洗脱的质粒DNA 溶液13,000rpm 确保已经做了步骤10,将离心吸附柱的乙醇残留去除;或者适当提高上样缓冲液浓度。
做步骤10,然后空气中晾几分钟,
入了溶液Ⅰ;溶液Ⅰ超过3个月的,可加入一些新RNase A 在溶液P1;处理量不要过量;菌体重悬于溶液Ⅰ后可放置几分钟让RNase A 充分起作用后再进行下一步。