由于辅导期增值税一般纳税人取得的已认证专用发票、海关进口增值税专用缴款书、废旧物资普通发票、货物运输发票及税务机关代开专用发票需要实行“先比对，后扣税”。
税务机关每月将采集的数据上传后进行交叉稽核比对，并将稽核比对结果反馈纳税人。经稽核比对相符的可以申报抵扣进项税额；稽核比对不符的由税务机关进行协查，协查结果允许抵扣的可申报抵扣进项税额。辅导期一般纳税人每月25—30日（接税务机关通知后）到办税服务厅领取《稽核比对结果通知书》及其明细清单和《增值税抵扣凭证协查结果通知书》。辅导期一般纳税人在接到税务机关《稽核比对结果通知书》及其明细清单和《增值税抵扣凭证协查结果通知书》的当月，按要求填写《增值税纳税申报表附列资料（表二）》，并于次月纳税申报期申报抵扣。未能取得《稽核结果比对通知书》，不得抵扣进项税额 税务机关在受理申报时，要进行票表比对，即将申报表填写的数据与税务机关稽核系统的数据进行比对，比对相符的可受理申报，比对不符的退纳税人核对后重新申报。
由于辅导期增值税一般纳税人取得的已认证专用发票、海关进口增值税专用缴款书、废旧物资普通发票、货物运输发票及税务机关代开专用发票需要实行“先比对，后扣税”。
税务机关每月将采集的数据上传后进行交叉稽核比对，并将稽核比对结果反馈纳税人。经稽核比对相符的可以申报抵扣进项税额；稽核比对不符的由税务机关进行协查，协查结果允许抵扣的可申报抵扣进项税额。辅导期一般纳税人每月25—30日（接税务机关通知后）到办税服务厅领取《稽核比对结果通知书》及其明细清单和《增值税抵扣凭证协查结果通知书》。辅导期一般纳税人在接到税务机关《稽核比对结果通知书》及其明细清单和《增值税抵扣凭证协查结果通知书》的当月，按要求填写《增值税纳税申报表附列资料（表二）》，并于次月纳税申报期申报抵扣。未能取得《稽核结果比对通知书》，不得抵扣进项税额 税务机关在受理申报时，要进行票表比对，即将申报表填写的数据与税务机关稽核系统的数据进行比对，比对相符的可受理申报，比对不符的退纳税人核对后重新申报。